EM菌能够很好的改良土壤，解磷解钾，还能丰富土壤里边的营养，能够让这个土壤里边的有益微生物增加，壮大菌群，其次是合理的调整碳氮比，因为土壤碳氮比是25:1，而最好的调节它的办法就是往土壤里边施用EM菌发酵液，因为它本身就是糖制作的，所以我们大量使用后就可以调碳氮比，我们用糖来平衡氮肥就是通过调整碳氮比。
第二个就是能起到松土、培根、固氮的作用。这个就是发酵土壤里边的有机肥，改良土壤团粒结构，提高土壤肥力，减少化肥的使用量，减少农药的使用量，抑制有害微生物的生存和繁殖。它可以在一定程度上减轻土传病害和连作障碍，抑制杂草滋生，增强植物的代谢能力，提高光合作用，促进种子发芽，促进秧苗根系发展。通过试验证明，EM菌有很好的促进生根的作用，促进秧苗早开花多结果、成熟期提前的作用，它能让我们投入的回报率增高。另外就是改善品质，让果实均匀膨大，色泽佳，尤其是它能调整酸碱度这一块。
对于这个EM菌原液在种植业上的使用方法，一种是叶面上喷施，叶面喷施千分之一到千分之四即可。第二个就是我们用它来发酵这个有机肥，我们发酵有机肥的时候加进去，让这个有机肥发酵的更彻底，还有就是直接冲施EM菌液，冲湿的时候，EM菌和我们这个化肥比例为1:20，另外还可以制作防虫液，就是使用这个EM菌发酵液，然后再加上糖，再加上点酒，再加上点醋，按1:1:1:1的这个比例，混合以后，这个虫子就会被吸引过来，掉到里边儿，而做成的防虫液。